附录 I — 参考资料与素材说明

I.1 阅读说明

本书涉及测序原理、数据格式、统计推断和分析工具。阅读时应结合对应工具的官方说明，核对适用版本、输入要求和分析假设。

历史命令、图中说明、算法数值例题和文献来源仍需继续校订，书中的分析流程尚未逐项在统一环境和数据上实际运行验证。网页可正常阅读不代表科学内容已全部验收。

I.2 参考资料

以下官方资料可用于进一步阅读与核对。正文中的其他参考链接与署名随对应内容保留。

资料	用途
Illumina SBS	边合成边测序与可逆终止
Illumina patterned flow cell	区分平台结构
SAM/BAM 规范	字段、标志和坐标
DESeq2 官方教程	counts 与归一化输入
GATK HaplotypeCaller	局部组装、似然与 gVCF 工作流
Oxford Nanopore 技术说明	纳米孔电流信号
PacBio RNA 测序	全长 cDNA 与 Iso-Seq

I.3 待完善的引用与素材

原稿 RNA-seq 部分有文献上标 1—13，但未提供完整的逐条参考文献表。本版保留编号并转换为可点击脚注，脚注明确标为“完整书目信息待完善”，不推测文献出处。

Windows/OpenSSH 部分两张石墨外链截图当前无法下载，保留图位并标为“原图待完善”。其他已引用图片均已整理到本地素材目录。

I.4 阅读形式

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