附录 G — 数学与算法扩展阅读

为避免整理时损失原有深度，本版把详细推导保留在相应正文位置。本附录提供统一入口；后续如将推导移至附录，应同时维护正文中的引用。

主题	阅读位置
双序列比对、哈希表、种子与 BWT	4.4 比对算法的直观原理
深度抽样与覆盖	4.1 测序抽样、深度、覆盖与复杂度
重复抽样与 PCR 冗余推导	4.7 重复 reads、UMI 与实验特异处理
信息熵、相对熵、SNE 与 t-SNE	5.7 稳健解释、可视化与常见统计误区
基因型似然与单倍型证据	8.4 基因型似然与局部单倍型重组装

推导中的符号统一、逐步练习、BWT 图例和全部数值例子的重新验算待完善。本轮记录的关键公式更正在维护记录中列出。